Nella navata centrale vi sono 6 vetrate, 3 a destra e 3 a sinistra, a forma lunata: esse sono opera del medesimo autore e risalgono al 1960, misurano 120x300 cm. Guardando l'altare maggiore, troviamo a destra, in ordine, nella prima e più vicina all'altare, un agnello seduto sulle Sacre Scritture con i 7 Sigilli e alle sue spalle la Croce e lo stendardo; tutto intorno la scritta: "Ecce Agnus Dei qui tollit peccata mundi" ''Ecco l'Agnello di Dio che toglie i peccati del mondo". La seconda porta la scritta "Una cum Episcopo semper", “Sempre insieme al Vescovo", e al centro è raffigurato il Duomo di Milano su uno sfondo dorato. All'interno della terza si vede un pellicano che nutre i suoi piccoli. L'immagine del pellicano che piega il becco verso il suo petto per nutrire i piccoli, fece nascere nell'immaginario medievale la credenza che questo animale si squarciasse il petto per nutrire col suo sangue i suoi nati. Di qui la sua estensione come simbolo di Cristo, che muore sulla croce e salva gli uomini con il suo sangue, forse anche dietro la suggestione del salmo 101,7, nel quale si dice: "Sono simile al pellicano". Così l'iscrizione sulla vetrata recita "Pie Pellicane munda tuo sanguine", “Pio Pellicano purifica con il tuo sangue”. Sull'altro lato, partendo dall'altare della B. V. Maria, nella quarta vetrata è rappresentata una croce da cui sgorgano due rivoli di sangue. Ai piedi della croce due cerve ne bevono. Dice la scritta: "Cum Sanguine tuum mundum redemisti" “Con il Tuo sangue hai redento il mondo”. La quinta rappresenta la Basilica di S. Pietro in Vaticano e porta l'iscrizione "Ubi Petrus ibi Ecclesia", “Dove è Pietro lì è la Chiesa”. Infine la sesta vetrata mostra un calice e dietro ad esso una croce con una vite; ai lati del calice due spighe di grano: sono i simboli dell''Eucarestia. L'iscrizione ricorda la liturgia eucaristica: "Hoc facite in commemorationem meam", “Fate questo in memoria di me”.